Master Océanographie spécialité Biologie Ecologie Marines

 

 

Le diplôme de Master Recherche d’Océanographie est un diplôme de l'Université d'Aix Marseille. Il comprend 3 spécialités, spécialité Biologie Écologie Marine, BEM (Master Recherche), Spécialité Physique et Biogéochimie (Master Recherche), spécialité Environnement marin (spécialité professionnelle),  La Responsable de la spécialité Biologie Ecologie marine est le Pr Valérie Michotey  (valerie.michotey@univ-amu.fr)...

 

La formation se déroule sur deux ans organisés en 4 semestres. Les enseignements se déroulent sur le campus de Luminy (Marseille).  Cet enseignement   introduit dans un premier temps les matières indispensables à la formation d’un océanographe puis va permettre à l’étudiant de choisir une voie de formation préférentielle, vers la recherche ou vers une insertion professionnelle à bac +5. Le choix La  spécialité commence au S2 du Master 1, après un tronc commun correspondant au S1 du M1 Océanographie...

 

La spécialité  BEM s'adresse aux étudiants ayant suivi un cursus Licence de Biologie (SV, Biochimie, Bio cellulaire) ou licence environnement (SNTE, STE, Biologie des populations) avec des unités de biologie en Licence..

.

 

Unité d’enseignement en M1 (période 2011-2017)

Les enseignements du premier semestre du M1 du Master d’Océanographie correspondent à un tronc commun quel que soit la spécialité choisie. Les spécialités (BEM, OPB ou Pro) commencent au semestre 2 du Master 1.

L’équipe pédagogique décide des enseignements que doivent suivre les étudiants afin de compléter leur formation de licence. La plus part des étudiants venant d’autre université et d’autre licences autre  que la licence SNTE parcours MER doivent généralement suivre les unités de mathématiques et statistique Les étudiants ayant obtenu la licence SNTE ont généralement les pré-requis en mathématique et statistique, peuvent suivre les unités projets en environnement. P

 

·     Les enseignement du M1S1

N° du semestre

Libellé de l’U.E

Crédits

CM

TD

TP

 

Parcours

 

 

 

(Volume  horaire  étudiant)

 

1

Océanographie Générale

6

40

20

 

Tronc commun

1

Océanographie Biologique

6

30

20

10

Tronc commun

1

Océanographie Chimique

6

24

16

20

Tronc commun

1

Anglais

6

 

39

 

Tronc commun

1

Océanographie physique

6

24

36

 

Tronc commun

1

Outils mathématiques pour les Sciences de l’Environnement

3

12

14

 

Optionnel-

1

Outils statistiques pour les Sciences de l’Environnement

3

12

12

 

optionnel

1

Projet en environnement I

3

 

30

 

optionnel

1

Projet en environnement II

6

 

60

 

optionnel

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

A l’issu d’entretiens pédagogiques individuels qui se déroulent au cours du Semestre 1 du M1, avec l’équipe pédagogique, les étudiants inscrits en M1 Océanographie, choisissent leur spécialité (OPB, BEM, ou Pro) . Il n’y a pas de quota, sauf pour la spécialité Pro.

 

·        Les enseignement du M1-S2 spécialité BEM

N° du semestre

Libellé de l’UE

Crédits

CM

TD

TP

 

Parcours

 

2

BEM 202 Méthodes quantitatives avancées pour le milieu marin

6

30

30

 

obligatoire

 

2

BEM 2011 Ecologie Microbienne et fonctionnement des écosystèmes

6

30

12

18

optionnel

 EMFE

2

BEM 201 Génétique des populations et phylogéographie

6

30

30

 

optionnel

 

2

BEM 203 Perturbations anthropiques

6

30

30

 

optionnel

 

2

OPB 207 Nutrition minérale des producteurs primaires

6

30

20

10

optionnel

NUT

2

OCE 201 Stage

6

 

 

4 semaines

optionnel

 

2

BEM 204 Diversité du vivant et rôle dans la biosphère marine

6

40

10

 

optionnel

 

2

BEM 205 Indicateurs de qualité du milieu marin

6

25

15

20

optionnel

 

2

BEM 206 Stratégie adaptative des organismes marins

6

30

10

10

optionnel

 

2

OPCB 211 Paléoclimatologie et paléo-océanographie

6

30

20

 

optionnel

 

2

OPCB 209 Initiation à la modélisation côtière

6

18

 

42

optionnel

 

2

BEM 07 Initiation à l’économie de l’environnement

6

30

20

 

optionnel

 

2

BEM 208 Hétérogénéité des écosystèmes marins

6

30

20

 

optionnel

HET

2

OPB 208 Analyse de séries chronologiques et traitement de signal

6

30

30

 

optionnel

SER

2

BEM 209 Modélisation en environnement marin

6

30

30

 

optionnel

 

 

Le descriptif bref de toutes les unités est disponible  ici

Fiche inscription pédagogique semestre 2 M1 BEM ici

 

Annales

2004-05-MODA

2004-2005- HET

2004-2005 FLUC

2004-2005 STRAT

2011-2013 EMFE session 1

2011-2013 EMFE session 2

2011-12 Indic session 1 Michotey

2011-12 session 2 Michotey

2011-2012 Annales complètes UE BEM

Annales BEM M2 2011-12.pdf

annales M2 BEM 2012-13.pdf

Annales M2-BEM 2014-15.pdf

 

·                                                       Unités d’enseignement en M2 (période sept 2012-2017)

Tous les enseignements sont optionnels. En début d’année, l’équipe pédagogique rencontre individuellement chaque étudiant et le conseille sur ses choix d’unité d’enseignement

N° du semestre

 

Libellé de l’UE

 

Crédits

 

CM

 

TD

 

TP

 

détail

 

 

 

(Volume  horaire  étudiant)

 

3

EMM : Ecologie microbienne marine avancée

6

30

6

14

EMM

3

ACLAP : Apprentissage classification et prévision

3

20

10

 

 

3

AERME1 : Approche Ecosystème ressource Marine  exploitée I

3

20

10

 

 

3

Ecotoxicologie marine

3

30

 

 

 

3

Ecologie des paysages marins

3

30

 

 

 

3

AERME2 : Approche Ecosystème ressource Marine  exploitée II

3

20

10

 

 

3

PROT 1: Protection restauration Gestion Durable  1

3

20

10

 

 

3

PROT 2: Protection restauration Gestion Durable 2

3

20

10

 

 

3

CONT : Hydrocarbures et contaminants organiques : devenir et impact

6

36

16

8

 

3

SDME : Système dynamique en écologie

3

20

10

 

 

3

SPAT : Statistique spatial

3

18

12

 

 

3

EVACO : Evolution adaptation et co- évolution

6

30

20

 

 

3

MEE :Macroévolution et environnement

3

15

7

8

Non ouverte en 2014/2015MacroEvol

3

Evolution des génomes, outils bio informatiques

6

24

10

16

 

 

Détail ici: descriptif UE S3  BEM 2012-2017.doc

 

 

· Semestre 4

Stage entre 4 et 6 mois en France ou à l’étranger

 

 

Insertion professionnelle

Le diplôme de Master d’Océanographie spécialité Biologie Ecologie Marine ouvre des perspectives d’emploi dans différentes problématiques de l’environnement en relation avec la composante biologique (espèces, ensembles fonctionnels) des écosystèmes.

L'étude des écosystèmes marins, de leur composante biologique et des interactions avec les paramètres de l'environnement, constitue aujourd'hui une nécessité impérative pour plusieurs raisons.

L'exploitation anarchique de la ressource que constituent ces écosystèmes a atteint ses limites ; leur exploitation durable doit se baser sur la compréhension d'un fonctionnement très complexe dont on commence à peine à comprendre quelques mécanismes et processus.

La variabilité naturelle des systèmes biologiques, à toutes les échelles d'organisation (du gène à l'écosystème), de temps et d'espace, est mal connue ; cela rend difficile la perception de la vraie dimension des perturbations, naturelles et anthropiques.

Aux perturbations naturelles s'ajoutent des perturbations d'origine anthropique  (exploitation des ressources, pollution, action de l'homme sur le climat, etc.) dont les mécanismes et les synergies sont mal connus.

Le rôle du compartiment microbien est fondamental dans le fonctionnement des écosystèmes et de leur état sanitaire,  leur l'extraordinaire diversité, taxonomique et fonctionnelle doit être prise en compte

La demande sociétale en vue de la conservation et de la gestion exige des bases scientifiques et théoriques solides pour ne pas se contenter d'une perception naïve et de solutions inefficaces à moyen terme.  La formation proposée donnera aux futurs scientifiques, ainsi qu'à la catégorie de gestionnaires qui se positionne entre la science et sa déclinaison en termes de gestion, les bases conceptuelles et les outils leur permettant de répondre à ces défis.

 

Statistique sur le devenir des étudiants de cette spécialité du master d’Océanographie

 

Devenir à 6 mois de la promotion 2012-2013 M2 BEM (total 24 diplômés)

 

 

 

 

Toujours sur cette même promotion, la figure ci-dessous présente  le devenir à 1 an des étudiants en fonction de leur classement

Nos étudiants postulent donc avec succès aux concours de recrutement des écoles doctorales dans la région mais également dans d’autres régions françaises et également à l’étranger (USA, Canada pour cette promotion ci).

 

·         Voici des sites web proposant des emplois ou des stages en environnement

http://www.reseau-tee.fr

http://wwz.ifremer.fr/Nous-rejoindre/

http://www.aires-marines.fr/Recrutement

http://www.eur-oceans.eu/?q=jobs

http://sirs.agrocampus-ouest.fr/AFH    à l'Association Française d'Halieutique (AFH).

L'AFH regroupe aujourd'hui plus de 200 scientifiques issus de disciplines et d'organismes divers : Ifremer, IRD, Agrocampus Ouest (ex Ensar), CNRS, Inra, Irstea (ex Cemagref), ONEMA, Université de Nantes, UBO, organismes de recherches francophones, etc

·         Sites proposant des bourses de thèses

En relation avec une entreprise (bourse cifre)       http://www.anrt.asso.fr/fr/espace_cifre

Ifremer    https://wwz.ifremer.fr/Nous-rejoindre/Bourses-de-recherche/

CEA  http://www-instn.cea.fr/formations/formation-par-la-recherche/doctorat/liste-des-sujets-de-these.html

Site web réseau des 15 universités marines fr  https://www.universites-marines.fr/fr/formations

 

 

Liste des sujets de stage de M2 proposés, année 2016-2017

 

Pour voir les détails cliquez sur le nom du fichier

 

sujet 2016-01.docxVariabilité inter-spécifique et intra-spécifique des cinétiques d’absorption des éléments nutritifs chez les diatomées du genre Pseudo-nitzschia

Encadrants : Dr. Juliette Fauchot  (juliette.fauchot@unicaen.fr ) , Aurore Sauvey , UMR BOREA (Biologie des ORganismes et Ecosystèmes Aquatiques) – http://borea.mnhn.fr Université de Caen Normandie, Caen,

 

sujet 2016- 02.pdf  Electrostimulation de microorganismes extrêmophiles issus de sources hydrothermales : quel est son rôle dans le développement de la biodiversité hydrothermale

Encadrants :  Guillaume Pillot (Doctorant) ; Pierre-Pol Liebgott (Chargé de Recherche) M.I.O Luminy Bat Oceanomed , pierre-pol liebgott pierre-pol.liebgott@univ-amu.fr

 

 

 

 

Liste des sujets de stage de M2 proposés, année 2015-2016

 

Pour voir les détails cliquez sur le nom du fichier

 

sujet 2015-01.docx  Impact d’une contamination pétrolière sur les communautés microbiennes de sédiments de la mangrove guyanaise

Encadrants: P Cuny & C Militon , M.I.O, Marseille

 

sujet 2015-02.docx  Réponses adaptatives des populations phytoplanctoniques aux changements de l’écosystème côtier étudiées avec des souches de dinoflagellés germées à partir de sédiments anciens

Encadrants: Raffaele Siano :chercheur Ifremer, Khadidja Klouch:   doctorante et ancienne étudiante master BEM, Laboratoire Ifremer Brest

 

sujet 2015- 03.pdf La pompe biologique pendant la campagne DEWEX : apports des mesures de taille du plancton

Encadrant s :L Berline et F Carlotti M.I.O, Marseille

 

sujet 2015-04.docx Effet de la sélectivité de filets à plancton sur les spectres de taille du zooplancton, Impact sur les estimations d'abondance et de biomasse du zooplancton. Application aux échantillonnages des programmes  MOOSE et ROMARIN

Encadrants  François Carlotti (MIO),  francois.carlotti@univ-amu.fr, Marc Pagano (MIO),  marc.pagano@mio.osupytheas.fr, Léo Berline (MIO), leo.berline@mio.osupytheas.fr, Claude Manté (MIO), claude.mante@mio.osupytheas.fr, M.I.O, Marseille

 

sujet 2015-05.docx  Etude des communautés microbiennes de subsurface du Massif Atlantis, dorsale Médio-Atlantique

Encadrante: Anne Postec  anne.postec@mio.osupytheas.fr , M.I.O, Marseille

 

sujet 2015- 06.pdf  Caractérisation d’un nouveau genre de bactéries thermo-­acidophiles isolées de sources chaudes volcaniques

Encadrants:  Gaël Erauso et Jean-Luc Cayol,  gael.erauso@univ--amu.fr , M.I.O, Marseille

 

sujet 2015-06.docx Processus associés au cycle  de l’azote dans les sédiments de l’étang de Berre soumis à des épisodes d’hypoxie et structure des communautés microbiennes associées

Encadrantes : P Bonin et V Michotey Patricia.bonin@univ-amu.fr, M.I.O, Marseille

 

sujet 2015-07.docx Le métabolisme du fer chez la bactérie magnétotactique marine QH-2

Encadrant s :Yannick Combet-Blanc, Maxime Fuduche, Sylvain Davidson  yannick.combet-blanc@univ-amu.fr , M.I.O, Marseille

 

sujet 2015- 08.pdf  Diversité intra et interspécifique au sein du genre Pseudonitzschia: Croissance et synthèse d’acide domoïque en milieux contrôlés.

Encadrants: Kimberley Lema et Mickaël Le Gac, aklema@ifremer.fr Dyneco/Pelagos, Centre Ifremer de Bretagne, 29280 Plouzané

 

sujet 2015-09.docx Impacts des marées vertes sur l’ichtyofaune des secteurs estuariens

Encadrants: Pr. Olivier Le Pape, Dr. Elodie Réveillac Elodie.Reveillac@agrocampus-ouest.fr ; Olivier.Le.Pape@agrocampus-ouest.fr Laboratoire d’écologie halieutique - UMR 985 Rennes, France

 

sujet 2015-10.doc Etude de l'effet d'une réserve de pêche sur la communauté de crustacés du Cap de Flamanville: Analyse de données de marquages et de séries temporelles de captures.

Encadrants: Ivan Schlaich et Bruno ErnandeIvan.Schlaich@ifremer.fr  et Bruno.Ernande@ifremer.fr , IFREMER, 14520 Port-en-Bessin

 

sujet 2015-11.docx Estimation bayésienne de distributions d’abondances de proies sur la base de contenus stomacaux : approches par modélisation

Encadrants: Jean-Christophe Poggiale , jean-christophe.poggiale@univ-amu.fr, Frédéric MENARD frederic.menard@mio.osupytheas.fr, MIO Marseille

 

sujet 2015-12.doc Effets de perturbations sur la dynamique de deux modèles de réseaux trophiques

Encadrants: Jean-Christophe Poggiale , jean-christophe.poggiale@univ-amu.fr, David Nerini,  david.nerini@univ-amu.fr, MIO Marseille

 

sujet 2015- 13.pdf Cycle du silicium dans le Pacifique sud-ouest pendant la campagne OUTPACE : rôle des différents groupes planctoniques dans l’assimilation de silice biogénique

Encadrante:  Karine Leblanc  karien.leblanc@univ-amu.fr MIO Marseille

 

sujet 2015- 14.pdf Mise au point d’une méthode d’analyse par reconnaissance d'images des fonds détritiques côtiers du Parc national de Port-Cros (Provence, France).

Encadrants: Davida Nerini  david.nerini@univ-amu.fr ,  Elodie Rouanet  elodie.rouanet@univ-amu.fr ,   Adrien.Goujard  adrien.goujard@univ-amu.fr ; Gis Posidonie, Marseille

 

sujet 2015- 15.pdf Importance des espèces biominéralisantes dans la composition de la matière en suspension et des agrégats au site PAP (Atlantique Nord)

Encadrantes: S. Schintu Jacquet,  Virginie Riou, Karine Leblanc, stephanie.jacquet@mio-osyupytheas.fr stephanie.jacquet@mio-osyupytheas.fr  MIO Marseille

 

sujet 2015- 16.pdf Suivi d’intégrons environnementaux dans des sédiments contaminés

Encadrante: Christine CAGNON Christine.cagnon@univ-pau.fr , Université de Pau

 

sujet 2015- 17.pdf  Modélisation de la dynamique des efflorescences d'Alexandrium minutum en compétition interspécifique. Impact de la diversité intraspécifique d’A. minutum sur la phénologie des blooms. Application à la rade de Brest

Encadrant: Martin Plus, Annie Chapelle, Marc Sourisseau,  Ifremer/DYNECO PELAGOS, Brest,   martin.plus@ifremer.fr , annie.chapelle@ifremer.fr , marc.sourisseau@ifremer.f

 

sujet 2015- 18.pdf Adaptation au long terme des capacités physiologiques d'une cyanobactérie diazotrophe

Encadrante : Sophie Rabouille Laboratoire d’Océanographie de Villefranche sur mer (LOV). Un hébergement à la station est possible,  srabouille@obs-vlfr.fr,

 

sujet 2015- 19.pdf Tracking nitrogen fluxes consequent to diazotrophy

Encadrante : Sophie Rabouille Laboratoire d’Océanographie de Villefranche sur mer (LOV). Un hébergement à la station est possible,  srabouille@obs-vlfr.fr,

 

sujet 2015-20.doc Importance  des espèces biominéralisantes dans la composition de la matière en suspension et des agrégats au site PAP (Atlantique Nord)

Encadrants : Fabrice Armougom, Patricia Bonin & Christian Tamburini, MIO-Campus Luminy, Marseille, MIO, Marseille contact christian.tamburini@univ-amu.fr 

 

sujet 2015- 21.pdf  DISSOLUTION DES CARBONATES EN MILIEU TEMPÉRÉ  DANS UN CONTEXTE DE CHANGEMENT GLOBAL :  LE CAS DU MAËRL

Encadrants  MARTIN Sophie, Aline Tribolet  sophie.martin@sb-roscoff.fraline.tribollet@ird.fr

 

sujet 2015- 22.pdf Evaluation de l’âge et de la croissance de première année du chevaine (Cyprinidae, Squalius cephalus) par l’étude des otolithes.

Encadrant :  Georges Carrel,  georges.carrel@irstea.fr Irstea, Centre d’Aix-en-Provence

 

sujet 2015-23.docx Replenishing Tetiaroa’s lagoon through capture, culture and restocking of fish and crustacean post-larvae

Encadrant  Dr. David LECCHINI, lecchini@univ-perp.fr : Il est à noter que Tetiaroa est une île très très isolée.

 

sujet 2015- 24.pdf Conchyliculture et ses conséquences sur le réseau microbien planctonique : Impact des mortalités de naissain d’huîtres dans la lagune de Thau

Encadrant : Dr Behzad Mostajir,  bmostajir@univ-montp2.fr Dr Béatrice Bec, MARBEC, Université de Montpellier IIDr Marion Richard,  Ifremer,

marion.richard@ifremer.fr,

 

sujet 2015-25.docx  Phylogénie et détection d'espèces cryptiques chez les oursins Schizastéridés incubants antarctiques et subantarctiques

Encadrants : Anne Chenuil (IMBE, Marseille, anne.chenuil@imbe.fr ), Thomas Saucède (unité Biogéosciences, Dijon)) et JP Féral (biodiversité marine Antarctique, oursins, IMBE), IMBE, Station Martine d'Endoume, Marseille

 

sujet 2015- 26.pdf Réponse des communautés de poissons lacustres à des pressions multiples.

Encadrants : Alban Sagouis (Doctorant), Christine Argillier (Directrice de Recherches), Irstea Aix-en-Provence. Equipe FRESHCO, christine.argillier@irstea.fr

 

sujet 2015- 27.pdf Cartographie du champ médian de contaminants chimiques à l’aide d’un modèle hydrodynamique. Application aux contaminants organiques hydrophiles sur la lagune de Thau

Encadrants : MUNARON Dominique & FIANDRINO Annie, IFREMER, SETE, dmunaron@ifremer.fr  / afiandri@ifremer.fr

 

sujet 2015- 28.pdf Building plankton genomic networks for deciphering the biological carbon pump in the global ocean

Encadrants  : Lucie Bittner (MCF UPMC, lucie.bittner@upmc.fr  ) , Lionel Guidi (CR1 CNRS, lguidi@obs-vlfr.fr  ) & Sakina-Dorothée Ayata (MCF UPMC, sakina@obs-vlfr.fr  ), UPMC Paris, LOV Villefrance sur mer

 

sujet 2015- 29.pdf Diversité biologique en milieu artificiel : influence du type d’habitat par une approche DNA-barcoding

Encadrant : Christophe Lejeusne , Station Biologique de Roscoff, clejeusne@sb-roscoff.fr 

 

sujet 2015- 30.pdf Optimisation des étapes de séquençage et de traitement des données

Encadrante : Aude FOURÇANS, Veolia Recherche et Innovation, 78603 Maisons-Laffitte, aude.fourcans@veolia.com  

 

 

sujet 2015- 31.pdf  Etude de la connectivité chez Crepidula fornicata par utilisation d’empreintes élémentaires larvaires.

Encadrant :  Thierry Comtet (comtet@sb-roscoff.fr ), Station Biologique, 29680 Roscoff

 

sujet 2015- 32.pdf Analyse de la biodiversité intraspécifique au sein du complexe d'espèces du genre Dipturus.

Encadrants : Samuel Iglesias iglesias@mnhn.fr , Thomas Barreau tbarreau@mnhn.fr Station marine du MNHN de Concarneau, UMR Borea , Jean-Luc Jung, jung@univ-brest.fr Laboratoire BioGeMME, Université de Brest

 

sujet 2015- 33.pdf Sélection de souches résistantes au chrome pour leurs utilisations en biorémédiation.

Encadrants : Johanne Aubé, PhD (johanne.aube@univ-pau.fr ) et Rémy Guyoneaud, Pr (remy.guyoneaud@univ-pau.fr) Université de Pau

 

sujet 2015- 34.pdf  Evaluation des pressions anthropiques et de la qualité des eaux lagonaires dans la baie de Faaroa (Raiatea, Polynésie française)

Encadrants :  Céline LAFABRIE, , UMR EIO (celine.lafabrie@upf.pf )  Caroline VIEUX, Communauté du Pacifique (carolinev@spc.int )  Vincent VAUCHEROT, Raiatea (Vincent.VAUCHEROT@raiatea.sdr.gov.pf )  Catherine GONZALEZ, Ecole des Mines d’Alès (catherine.gonzalez@mines-ales.fr),     UMR 241 « Ecosystèmes Insulaires Océaniens », Université de la Polynésie française (UPF), Tahiti, Polynésie française

 

sujet 2015-35.docx Mesure de fragments de plastiques. Optimisation de la technique Zooscan et étude de la distribution en zone côtière Méditerranéenne.

Encadrants : D Thibault R Sempere , M.I.O Marseille

 

sujet 2015-36.docx Etude métagenomique des communautés microbiennes bathypélagiques

Encadrants : C Tamburini  (Christian Tamburini christian.tamburini@univ-amu.fr) , P Bonin M.I.O Marseille

 

sujet 2015-37.docx Structure de la communauté phytoplanctonique en Méditerranée Nord-occidentale en relation avec les caractéristiques hydrologiques: Campagne OSCAHR

Encadrants : Gérald GREGORI et Melilotus THYSSEN  gerald.gregori@mio.osupytheas.fr , Melilotus.Thyssen@mio.osupytheas.fr M.I.O Marseille  

 

sujet 2015- 38.pdf  Modélisation de la distribution de la crépidule sur les côtes de Manche-Atlantique

Encadrants : Alain Ménesguen, tel : 02-98-22-43-34, courriel : amenesg@ifremer.fr, Philippe Cugier, tel : 02-98-22-49-19, courriel : pcugier@ifremer.fr , Centre Ifremer de Bretagne,

Plouzané.

 

sujet 2015-39.docx Quels Sentiers LIttoraux pour demain ? Analyse prospective et pluridisciplinaire de l’aménagement des sentiers côtiers en Méditerranée.

Encadrants   Samuel Robert : Samuel.ROBERT@univ-amu.fr

 

sujet 2015- 40.pdf Analyse des facteurs impliqués dans la variation spatio-temporelle des mortalités des huîtres creuses, Crassostrea gigas

Encadrants : Julien Normand (Julien.Normand@ifremer.fr  ) & Aline Gangnery (Aline.Gangnery@ifremer.fr  ) (LER/N, Port En Bessin), IFREMER Port en Bessin

 

sujet 2015- 41.pdf Efflorescences phytoplanctoniques en zone côtière : Croissance, broutage et état trophique des communautés microbiennes planctoniques.

Encadrants : Behzad MOSTAJIR : (MARBEC),Behzad. Mostajir@univ-montp2.fr  , Francesca VIDUSSI :  Francesca.vidussi@univ-montp2.fr, Sébastien MAS  Sebastien.Mas@univ-montp2.fr Financement de thèse acquis

 

 

 Liste des sujets de stage de M2 proposés, année 2014-2015

 

 

(Détails du sujet  en cliquant sur titre du fichier en  début de ligne)

sujet 2014-1.docx Isolement et caractérisation de souches bactériennes anaérobies d’environnements acides et leur implication dans la réduction de composés soufrés ou dans la spéciation de l’arsenic

Encadrante : Agnès Hirschler-Réa, Maître de Conférences HC, HDR, MOI, Equipe MEB, Luminy, Marseille, agnes.hirschler@univ-amu.fr tél : 04 91 82 86 81 sujet pourvu

 

sujet 2014- 2.pdf Etude inter-populationnelle de l’impact du cadmium sur les mécanismes osmorégulateurs de Gammarus fossarum.

Encadrant : Julien Issartel (AMU), Jehan-Hervé Lignot (UM2) et Guy Charmantier (UM2). julien.issartel@imbe.fr Marseille,

 

sujet 2014-3.doc Etude de la colonisation de larves de coraux tropicaux par la microflore perforante à différents stades de développement

Encadrantes : Aline Tribollet (CR1, IRD, UMR IPSL-LOCEAN   à Bondy , ), Isabelle Domart-Coulon (MC, MNHN, UMR MCAM) Aline.tribollet@ird.fr      et    icoulon@mnhn.fr sujet pourvu

 

sujet 2014-4.docx Détection et étude de virus géants par la mise en culture d’échantillons environnementaux en présence d’amibes des genres Acanthamoeba et Dictyostelium

 Encadrants : Nadège Philippe, Ingénieur de Recherche CNRS  et Chantal Abergel, Directeur de Recherche CNRS (Chantal.Abergel@igs.cnrs-mrs.fr) Laboratoire Information Génomique & Structurale  UMR7256-CNRS, Aix-Marseille Université Parc Scientifique de Luminy

 

 sujet 2014-5.doc Etude expérimentale de l’impact de la disponibilité en carbone et en fer pour les bactéries hétérotrophes à l’aide de mutants et bio-rapporteurs.

 Encadrante : Ingrid Obernosterer, Laboratoire d’Océanographie Microbienne (LOMIC), Obsérvatoire Océanologique de Banyuls, 66650 Banyuls-sur-mer (Ingrid.obernosterer@obs-banyuls.fr, tel : 0468887353 )

 

 sujet 2014-6.doc  Bioremédiation par Holothuria scabra dans le contexte de la crevetticulture en Nouvelle-Calédonie

 Encadrants : Gauthier Schaal, Université de Bretagne Occidentale (Gauthier.Schaal@univ-brest.fr , 02 98 49 86 90), Edouard Kraffe (MCF, UBO, edouard.kraffe@univ-brest.fr), Anne Lorrain, IRD-Nouméa

(anne.lorrain@ird.fr ; Tél : +687 26 07 86) & Yves Letourneur, Université de la Nouvelle-Calédonie, Laboratoire LIVE ( yves.letourneur@univ-nc.nc  ; Tél : +687 29 03 85)

 

 sujet 2014- 7.pdf Experimental assessment of the sensitivity of marine nitrogen fixers to the phosphorus resource

 Encadrants : Sophie Rabouille,   srabouille@obs-vlfr.fr    Phone   +33(0)493 763 832,  Andreas Oschlies , aoschlies@geomar.de  Phone +49 431 600-1936,  Angela Landolfi alandolfi@geomar.de  Phone +49 431 600-4283,

Solange Duhamel, sduhamel@ldeo.columbia.edu Phone +01 845-365-8774 ;   Laboratoire d'Océanographie de Villefranche (LOV), UMR 7093, CNRS & Université Paris VI - Station Zoologique-B.P. 28 F-06234, Villefranche-Sur-Mer

 

sujet 2014-8.doc Caractérisation de la perturbation de la reproduction suite à une exposition chronique à un mélange environnemental de PCB et de PBDE, conséquences sur les performances de la descendance.

Encadrants : Marie-Laure Bégout - mlbegout@ifremer.fr , Xavier Cousin - xcousin@ifremer.fr Ifremer , Place Gaby Coll, 17137 L’Houmeau (près La Rochelle) 05 46 50 06 21, Forte probabilité de bourse de thèse

 

sujet 2014-9.doc Liens entre cheminement de la matière organique et les taux de contaminations métallique et organique au sein des réseaux trophiques des écosystèmes coralliens : une comparaison trans-Pacifique

Encadrants : Yves Letourneur, Université de la Nouvelle-Calédonie, Laboratoire LIVE ( yves.letourneur@univ-nc.nc   ; Tél : +687 29 03 85) & Paco Bustamante, Université de La Rochelle, UMR LIENSs (pbustama@univ-lr.fr  ; Tél : 06 12 25 58 20 sujet pourvu

 

sujet 2014-10.docx Etude comparative de la diversité génétique entre deux espèces interfertiles, l’une indigène et l’autre non-indigènes, en situation de sympatrie : le cas de l’ascidie Ciona intestinalis spp.

Encadrants : Frédérique Viard (DR CNRS) , Equipe Divco - Laboratoire « Adaptation & Diversité en Milieu Marin » (UMR 7144 CNRS UPMC) – Station Biologique de Roscoff ( viard@sb-roscoff.fr )

 

sujet 2014- 11.pdf EDGE: l'effet de la bordure d'un habitat à Zostera marina sur les communautés associées

Encadrante : Francesca Rossi Laboratoire ECOSYM , Université de Montpellier 2 Bat 24. Pl E Bataillon 34000 MONTPELLIER ( francesca.rossi@univ-montp2.fr)

 

sujet 2014- 12.pdf Changement climatique et populations benthiques : approche bioénergétique (DEBCLIM)

Encadrant : C. Bacher (cedric.bacher@ifremer.fr), Centre Ifremer de Brest, département DYNECO (www.ifremer.fr/dyneco),

 

plusieurs sujets 2014-13.docx  Protein expression in diatoms,  Morphological adaptation of diatoms, Zooplankton, Desalination, Microbial biofouling in desalination systems

Encadrante : Leterme, Sophie, sophie.leterme@flinders.edu.au, Biological Oceanographer | Deputy Node Leader of SA-IMOS, Head of the Plankton Ecology Lab, Senior Lecturer

School of Biological Sciences, Flinders University GPO BOX 2100, Adelaide SA5001

http://www.flinders.edu.au/people/sophie.leterme

 

sujet 2014-14.docx Estimation bayésienne de distributions d’abondances de proies sur la base de contenus stomacaux : approches par modélisation

Encadrants : -    Frédéric MENARD (DR IRD) : MIO – Case 901 – Campus de Luminy – 13288 Marseille

Tel : 04 86 09 06 27 – email : frederic.menard@mio.osupytheas.fr, Jean-Christophe POGGIALE (PR) : MIO – Case 901 – Campus de Luminy – 13288 Marseille

Tel : 04 86 09 06 36 – email :  jean-christophe.poggiale@univ-amu.fr

 

sujet 2014-15.docx Analyse de la biodiversité des mammifères marins dans l'écosystème particulièrement riche des côtes de la Mauritanie et du Sénégal.

Encadrant : Jean-Luc Jung, jung@univ-brest.fr, Laboratoire BioGeMME, Brest

 

sujet 2014-16.docx Implication fonctionnelle/physiologique de la voie paracellulaire dans la calcification du corail Stylophora pistilatta.

Encadrants : Encadrant : Dr Philippe Ganot et  Dr Sylvie Tambutté, , équipe de Physiologie/Biochimie Centre Scientifique de Monaco

Quai Antoine 1° pganot@centrescientifique.mc ; stambutte@centrescientifique.mc

 

sujet 2014-17.docx Etude de la mise en place d’épisodes d’anoxie sur les processus associés au cycle de l’azote – Etude en mésocosme

Encadrants : Bonin P. (DR CRNS) ; Grenz C (DR CNRS). MIO, Luminy, Marseille. patricia.bonin@univ-amu.fr

 

sujet 2014-18.doc  Etude expérimentale de la médiation chimique au sein des communautés benthiques de substrats durs

Encadrant : Thierry Pérez, DR CNRS IMBE.  thierry.perez@imbe.fr   / 04 91 04 16 29 sujet pourvu

 

sujet 2014-19.docx Réponse de Photobacterium phosphoreum ANT2200 aux changements maîtrisés des conditions de croissance

Encadrant : Laurie Casalot (CR-IRD ; laurie.casalot@univ-amu.fr ), Christian Tamburini (DR-CNRS ; christian.tamburini@univ-amu.fr ), MIO-Campus Luminy, Marseille

 

sujet 2014- 20.pdf Les enzymes lipolytiques chez la microalgue marine Isochrysis galbana

Encadrantes : Céline LOISEAU Tel : 02 43 59 49 51 – cloiseau@univ-lemans.fr, Josiane HERAULT  Tel : 02 43 59 49 50 – herault@univ-lemans.fr, Université du Mans

 

sujet 2014- 21.pdf Impact de la température sur les interactions Phytoplancton-Virus

Encadrants : Nathalie Simon (simon@sb-roscoff.fr), Anne-Claire Baudoux (acbaudoux@sb-roscoff.fr),  David Demory (david.demory@sb-roscoff.fr ), station biologique Roscoff

 

sujet 2014-22.docx   écologie trophique et fonctionnelle des copépodes dans l’étang de Berre

Encadrants : Delphine Thibault et Marc Pagano , MIO- , Marseille  (delphine.thibault@univ-amu.fr ) sujet pourvu

 

sujet 2014- 23.pdf  Distributions en taille du plancton et des particules en relation avec le mélange vertical à deux stations côtières méditerranéennes.

Encadrants : Léo Berline (MIO), leo.berline@univ-amu.fr, 04 86 09 06 33,  François Carlotti (MIO), francois.carlotti@univ-amu.fr

 

sujet 2014- 24.pdf   Adaptation au long terme des capacités physiologiques d'une cyanobactérie diazotrophe

Encadrants : Sophie Rabouille  srabouille@obs-vlfr.fr, Olivier Bernard  olivier.bernard@inria.fr , observatoire de Villefranche sur mer

 

sujet 2014- 25.pdf Amélioration de séries de Captures Par Unité d'Effort pour les flottilles ciblant les "gadidés" en Mer Celtique

Encadrants : Lionel Pawlowski (IFREMER – STH Lorient) (lionel.pawlowski@ifremer.fr) , Marianne Robert (IFREMER – STH Lorient)

 

sujet 2014- 26.pdf  Analyse de la variabilité spatiale et temporelle des rejets en Mer Celtique

Encadrants : Marianne Robert (IFREMER – STH Lorient) (marianne.robert@ifremer.fr) , Lionel Pawlowski(IFREMER – STH Lorient)

 

sujet 2014- 27.pdf  Compétition interspécifique et efflorescences d'Alexandrium minutum en rade de Brest, Impact de la diversité du phytoplancton, de la germination  et des conditions environnementales majeures

Encadrants : Martin Plus, Annie Chapelle, Marc Sourisseau ; Laboratoire d'accueil : DYNECO PELAGOS, Ifremer Brest BP70 29280 Plouzané, martin.plus@ifremer.fr, annie.chapelle@ifremer.fr, marc.sourisseau@ifremer.fr

 

sujet 2014-28.docx Estimation des paramètres d’un modèle DEB

Encadrants : -    David NERINI MIO – Jean-Christophe POGGIALE Case 901 – Campus de Luminy – 13288 Marseille

Tel : 04 86 09 06 30  david.nerini@univ-amu.fr, jean-christophe.poggiale@univ-amu.fr

 

sujet 2014-29.docx  facteurs contrôlant le développement d’une souche phytoplanctonique

Encadrantes : Denis de la Broise  (Denis.de-labroise@univ-brest.fr)); Marie Boye (marie.boye@univ-brest.fr )

 

 sujet 2014- 30.pdf Evaluation des peuplements de juvéniles de poissons et cartographie des nourriceries au sein des petits fonds rocheux de la côte Catalane (Espace Transfrontalier Catalan)

Encadrants : Adrien CHEMINEE (Dr.), Jérémy PASTOR (Dr.) Université de Perpignan - CEFREM (UMR 5110 CNRS-UPVD) - CREM

Centre de Recherche sur les Ecosystèmes Marins, Impasse du solarium, 66420 Le Barcarès, France  adrien.cheminee@univ-perp.fr

 

sujet 2014- 31.pdf  Prise en compte des connaissances des pêcheurs thoniers à la senne sur l’évolution de la capturabilité due à l’introduction des nouvelles technologies à bord dans les modèles Bayésiens de production excédentaire.

Encadrants : Daniel Gaertner (IRD) et Marie Pierre Etienne (AgroParisTech) Institut de Recherche pour le Développement, UMR EME, Sète – France   (daniel.gaertner@ird.fr ),

  (marie.etienne@agroparistech.fr )

 

sujet 2014- 32.pdf  Evolution du recrutement du gastéropode invasif Crepidula fornicata en rade de Brest

Encadrants : Antoine CARLIER Stéphane POUVREAU ; Laurent CHAUVAUD, IFREMER, Centre de Bretagne ; Laboratoire DYNECOEcologie Benthique , Antoine.Carlier@ifremer.fr

 

sujet 2014- 33.pdf  Dynamique des communautés bactériennes de boues activées lors de leur enrichissement en populations Anammox

Encadrants : Patrick Dabert (DR) Sophie Le Roux (TR) et Romain Connan (Doctorant)lieu : …Irstea Rennes

 

sujet 2014- 34.pdf Analyse de la variabilité saisonnière et bisannuelle des ressources trophiques pélagique et benthique disponibles pour la faune benthique de l’archipel de  Chausey

Encadrants : Pr. Frédéric Olivier  folivier@mnhn.fr , /frederic_olivier@uqar.ca Pr. Tarik Meziane:  meziane@mnhn.fr

 

sujet 2014-35.docx  Évolution à long-terme de l’écosystème Sud Golfe de Gascogne en réponse aux forçages climatiques et anthropiques

Encadrants : Susperregui, Nicolas, Del Amo, Yolanda, David, Valérie ; yolanda.del-amo@u-bordeaux.fr, Université Bordeaux

 

sujet 2014-36.docx Initiation des blooms phytplanctoniques : Etude de l’activité photosynthétique et de la production

Encadrants : Francesca VIDUSSI : chercheur CNRS, Ecologie des Systèmes marins Côtiers, Place E Bataillon, CC093, 34095 MONTPELLIER.

Francesca.vidussi@univ-montp2.fr   , Emilie Le Floc’h : Ingénieur CNRS,.  Emilie.LeFloch@univ-montp2.fr , Financement de thèse acquis sur ANR

 

 sujet 2014- 37.pdf Analyse comparative de l’impact sur les communautés marines pélagiques de la pêche sous dispositifs de Concentration de Poissons et de la pêche en bancs libres par les thoniers senneurs tropicaux

Encadrants : Monique Simier (IRD) et Frédéric Ménard (IRD), Institut de Recherche pour le Développement, UMR EME Centre de Recherche Halieutique Méditerranéenne et Tropicale, Sète – France

((monique.simier@ird.fr) ((frederic.menard@ird.fr)

 

sujet 2014- 38.pdf  Utilisation d’empreintes élémentaires larvaires pour l’étude de la connectivité chez Crepidula fornicata

Encadrants : Thierry Comtet (comtet@sb-roscoff.fr), UMR 7144 ADMM, Equipe Diversité et Connectivité dans les Paysages Marins Côtiers, Station Biologique, 29680 Roscoff. Julien Thébault (julien.thebault@univ-brest.fr), UMR 6539 LEMAR, IUEM, Univ. De Bretagne Occidentale, Technopôle Brest-Iroise, Rue Dumont d'Urville 29280 Plouzané

 

sujet 2014-39.docx  Estimation de l’état trophique, de la croissance et du broutage des communautés microbiennes planctoniques au cours d’efflorescences phytoplanctoniques dans la lagune de Thau

Encadrants : Behzad MOSTAJIR : Directeur de Recherche CNRS, UMR 5119 Ecologie des Systèmes marins Côtiers, Place E Bataillon, CC093, 34095 MONTPELLIER.

Behzad.Mostajir@univ-montp2.fr , Francesca VIDUSSI : Chercheur CNRS, Ecologie des Systèmes marins Côtiers, Place E Bataillon, CC093, 34095 MONTPELLIER. Francesca.vidussi@univ-montp2.fr

Sébastien MAS : Ingénieur de Recherche CNRS, Centre d’Ecologie Marine Expérimentale MEDIMEER. SMEL, 2 Rue des Chantiers, 34200 SETE. Sebastien.Mas@univ-montp2.fr, Financement de thèse acquis sur ANR

 

sujet 2014- 40.pdf Caractérisation des symbiontes bactériens au sein des stades de vie précoces des gastéropodes hydrothermaux Alvinoconcha spp

Encadrants : . Florence Pradillon (Laboratoire Environnement Profond / EEP)  florence.pradillon@ifremer.fr, Tel : 02-98-22-49-57 et Marie-Anne Cambon-Bonavita et Valérie Cueff-Gauchard (Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes / EEP).

 

sujet 2014- 41.pdf  Etude de la sensibilité des communautés phytoplanctoniques lagonaires aux pressions de contamination chimique

Encadrantes Céline LAFABRIE, Maître de conférences UPF, UMR EIO (celine.lafabrie@upf.pf), Martine RODIER, Chargée de Recherche IRD, UMR EIO (martine.rodier@ird.fr ) lieu université de polynésie UPF. mais les frais de voyage entre la métropole et la Polynésie seront à la charge du stagiaire

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Liste des sujets de stage de M2 proposés, année 2013-2014

 

(Détail en cliquant sur titre fichier en  début de ligne)

sujet 2013- 01.pdf  Caractérisation spatio-temporelle du potentiel reproducteur du bénitier T. maxima en Polynésie française

Encadrant : Nabila Gaertner-Mazouni Université de la Polynésie française –Tahiti- nabila.gaertner-mazouni@upf.pf  -attention billet avion NON pris en charge par le Labo

 

sujet 2013- 02.doc  Etude des effets des rayonnements ionisants sur l’abeille

Encadrant : Gagnaire Béatrice  beatrice.gagnaire@irsn.frBelzunces Luc  luc.belzunces@avignon.inra.fr, Le stage sera majoritairement réalisé à l’IRSN de Cadarache (Laboratoire d’Ecotoxicologie des Radionucléides) avec des missions à l’INRA d’Avignon (Laboratoire de Toxicologie Environnementale)

 

sujet 2013- 03.docx Spécificité des interactions microalgue-parasitoide

Encadrements : Laure Guillou (lguillou@sb-roscoff.fr ) et Raffaele Siano (Raffaele.Siano@ifremer.fr), station Biologique de Roscoff (http://ww.sb-roscoff.fr), dans l’équipe Diversité et Interactions au sein du plancton Océanique (http://www.sb-roscoff.fr/Phyto/).

 

sujet 2013- 04.doc Evolution temporelles des populations de dinoflagellés suite aux phénomènes   d’eutrophisation du milieu côtier

Encadrements : Raffaele Siano (Raffaele.Siano@ifremer.fr), Laure Guillou (lguillou@sb-roscoff.fr ) Ifremer Brest

 

sujet 2013- 05.docx Structuration génétique péri-corse (marqueur microsatellite) du denti, sparidé marin côtier.

Encadrants : Patrick Berrebi (Patrick Berrebi <patrick.berrebi@univ-montp2.fr ) de l'Institut des Sciences de l’Evolution de Montpellier,  Costas Tsigenopoulos de l'Hellenic Center for Marine Research  et la Plateforme marine Stella Mare de Eric Durieux de l'Université de Corse Pasquale Paoli.  L'étudiant sera basé à l'ISEM de Montpellier.

 

sujet 2013- 06.doc Etude des voies de contamination du bénitier Tridacna maxima par les toxines de type ciguatéra

Encadrantes : Taiana DARIUS,Chargée de Recherche, ILM( tdarius@ilm.pf); Mélanie ROUE, Post-doctorante, IRD Tahiti( melanie.roue@ird.fr), Nabila GAERTNER-MAZOUNI Professeur, UPF( nabila.gaertner-mazouni@upf.pf)

 

sujet 2013- 07.doc Diversité et activité des communautés microbiennes d’un écosystème hydrothermal alcalin, le site de Prony en Nouvelle Calédonie. Culture et isolement de nouvelles souches microbiennes

Encadrante : Anne POSTEC (MCU) - anne.postec@univ-amu.fr - Institut Méditerranéen d’Océanologie (MIO), Université Aix Marseille, équipe Microbiologie Environnementale et Biotechnologie (MEB)

 

sujet 2013- 08.pdf Potentiel d’hybridation entre espèces indigènes et non-indigènes d’un même complexe d’espèce :que peut nous apprendre une analyse moléculaire des stades juvéniles de Ciona intestinalis(Ascidiacea) ?

Encadrante : Frédérique Viard (directrice de recherche ;  viard@sb-roscoff.fr), Sarah Bouchemousse(doctorante) - Laboratoire d’accueil : Equipe Div&Co ; Laboratoire Adaptation et Diversité en Milieu Marin (UMR7144 CNRS UPMC), Station Biologique de Roscoff

 

sujet 2013- 09.docx Importance du groupe des SAR202 appartenant au phylym des Chloroflexi dans  le fonctionnement  du domaine océanique profond

Encadrants : Patricia Bonin (DR-CNRS ) Christian Tamburini (CR-CNRS ; christian.tamburini@univ-amu.fr), Marc Garel (IE-CNRS; marc.garel@univ-amu.fr)), MIO-Campus Luminy, équipe Microbiologie Environnementale et Biotechnologie (MEB), Marseille

 

sujet 2013- 10.pdf Caractérisation du bloom planctonique printanier dans la zone de convection profonde de Méditerranée Nord-occidentale-Campagne DEWEX :

Encadrants : K Leblanc (karine.leblanc@univ-amu.fr), Gerald Gregori. MIO, Campus de Luminy, Marseille

 

sujet 2013-11.docx Analyse de la variabilité spatiale et temporelle du transport de larves de soles  dans le Golfe de Gascogne

Encadrants: Marie Savina-Rolland , IFREMER Manche Mer du Nord, (Marie.Savina.Rolland@ifremer.fr )Olivier Le Pape,UMR ESE,  Agrocampus Ouest, Rennes, lieu stage : Laboratoire Ressources Halieutiques, centre  IFREMER Manche Mer du Nord, Boulogne sur Mer

 

sujet 2013- 12.doc Analyse des relations entre l’alimentation, les habitats et les contraintes morpho-anatomiques des mâchoires chez les poissons anguilliformes de Nouvelle-Calédonie

Encadrants : Yves Letourneur, Université de la Nouvelle-Calédonie, Laboratoire LIVE (yves.letourneur@univ-nc.nc  ; Tél : (+687) 29 03 85) & Xavier Bonnet / François Brischoux, CNRS, Centre de Chizé (bonnet@cebc.cnrs.fr / francois.brischoux@gmail.com  ; Tél : 05 49 09 78 79)

 

sujet 2013-13.docx Etude de la distribution du phytoplancton en Manche occidentale par une approche automatisée et haute fréquence

Encadrant : Melilotus Thyssen, ( melilotus.thyssen@univ-amu.fr ), MIO, Campus de Luminy, Bâtiment TPR1, 13288 Marseille Cedex 09.

 

sujet 2013- 14.pdf Caractérisation d'intégrons environnementaux

Encadrante :  Dr Christine Cagnon Maître de conférences, HDR, Université de Pau et des Pays de l'Adour IPREM UMR CNRS 5254 - Equipe Environnement et Microbiologie (christine.cagnon@univ-pau.fr )

 

sujet 2013- 15.doc Variations ontogéniques et saisonnières de la contamination métallique chez Scorpaena porcus (Poisson Téléostéen) dans les herbiers de posidonies.

Encadrantes : Sandrine Ruitton & Mireille Harmelin-Vivien

( sandrine.ruitton@univ-amu.fr ) – MIO, EMBIO, Campus de Luminy & IUT de La Ciotat,  (mireille.harmelin@univ-amu.fr )- MIO, EMBIO, Station Marine d'Endoume

 

sujet 2013- 16.pdf Impact de nanoparticules métalliques sur les écosystèmes microbiens en microcosme

Encadrant : Maialen BARRET, Maître de Conférences à l’INPT-ENSAT/ laboratoire EcoLab, (maialen.barret@ensat.fr),   Ecole Nationale Supérieure d’Agronomie de Toulouse, Laboratoire Ecologie Fonctionnelle et Environnement

 

sujet 2013- 17.doc Effets in situ de facteurs environnementaux tels que l’acidification des océans et l’eutrophisation sur la microbioérosion récifale

Encadrante : Aline Tribollet, Chargée de Recherche IRD à l’UMR IPSL-LOCEAN

Centre IRD France-Nord, 32 Av. Henri Varagnat 93143 Bondy Cedex

Tél : 01 48 02 55 35     E-mail : aline.tribollet@ird.fr

 

sujet 2013- 18.pdf Impact des efflorescences de dinoflagellés toxiques Alexandrium minutum et Karenia mikimotoi sur la coquille Saint Jacques Pecten maximus

Encadrant : : Romain Morvezen, Jean Laroche, Pierre Boudry, Hélène Hégaret, Philippe Soudant. Laboratoire d’accueil : UMR 6539 UBO/CNRS/IRD/Ifremer LEMAR – IUEM. Rue Dumont d’Urville, 29280 Plouzané.

 

sujet 2013- 19.docx Etude de la part de reproduction asexuée chez l’holothurie Stichopus chloronotus et de sa distribution spatiale saisonnière à la Réunion

Encadrant : Magalon Hélène, (helene.magalon@univ-reunion.fr,( Laboratoire ECOMAR, Université de la Réunion

 

sujet 2013- 20.pdf Biogéochimie de la matière organique dissoute à l’interface océan-atmosphère : rôle des apports atmosphériques

Encadrante : Elvira Pulido-Villena ; Institut Méditerranéen d’Océanologie, (elvira.pulido@univ-amu.fr  ) , Luminy

 

sujet 2013- 21.doc Structure génétique des populations du bryozoaire Myriapora truncata, bioconstructeur et composante du coralligène, un écosystème typiquement méditerranéen. Inférences sur la connectivité à différentes échelles spatiales et l’influence du faciès écologique.

Encadrante : Anne CHENUIL par e-mail : anne.chenuil@imbe.fr, Station Marine d’Endoume Chemin de la batterie des lions 13007 MARSEILLE

 

sujet 2013- 22.doc Rôle des lipides membranaires dans la sensibilité du phytoplancton aux composés allélopathiques produits par le dinoflagellé Alexandrium minutum

Encadrants : Philippe Soudant ; Hélène Hégaret & Fabienne Le Grand, université de Brest,  (philippe.soudant@univ-brest.fr   ; Helene.hegaret@univ-brest.fr; Fabienne.legrand@univ-brest.fr.

 

sujet 2013- 23.doc Modélisation de la réponse d’une communauté à une perturbation anthropique : approche écosystémique de la pêche

Encadrants : JC Poggiale & D Nerini, M I O, Campus Luminy, Marseille, (jean-christophe.poggiale@univ-amu.fr, david.nerini@univ-amu.fr)

 

sujet 2013- 24.pdf Analyse de la variabilité spatio-temporelle des captures et de l’effort de pêche en Mer Celtique

Encadrants : Marianne Robert (IFREMER – STH Lorient, marianne.robert@ifremer.fr), Co encadrement : Lionel Pawlowski (IFREMER – STH Lorient

 

sujet 2013- 25.docx Analyse de la série  temporelle zooplancton en Baie de Marseille et des paramètres environnementaux ( de SOMLIT et de SPECIMED (MERMEX) )

Encadrants : F Carlotti, (Francois.carlotti@univ-amu.fr )en co-direction avec David Nerini., MI0, Campus de Luminy

 

sujet 2013- 26.docx Modélisation bioénergétique des méduses (Pelagia noctiluca)

Encadrants : F Carlotti, (Francois.carlotti@univ-amu.fr) (MI0), en co-direction avec J.C. Poggiale(MI0, )  et F. Lombard (LOV).

 

sujet 2013- 27.pdf Etude de la diversité des peuplements coralliens en soutien à la création d’une AMP en milieu insulaire tropical

Encadrants : Mayalen ZUBIA, mayalen.zubia@upf.pf, Université de Polynésie française (UPF)

Jean Claude GAERTNER, jean-claude.gaertner@ird.fr, Institut de Recherche et de Développement (IRD)

 

sujet 2013- 28.docx Interactions allélopathiques en milieu marin : caractérisation du pouvoir algicide des herbiers à Zostère sur le dinoflagellé neurotoxique Alexandrium catenella

Encadrants : Mohamed Laabir (MC, UM2) UMR ECOSYM – Equipe ETDA

Co-responsable : Mme Micheline Grignon (DR CNRS, Bordeaux)

UMR EPOC - Equipe ECOBIOC, axe Santé des populations, qualité des écosystèmes, lieu ECOSYM   UMR 5119 CNRS-UM2 Université Montpellier 2

 

sujet 2013- 29.docx Echange lagon /Océan des lagons chenaux en  Nouvelle Calédonie  importance des transferts trophiques entre le zooplancton et les téléostéens lagunaires

Encadrants : Marc Pagano (marc.pagano@univ-amu.fr )

Co-responsables : Jean Blanchot et Daniela Banaru (daniela.banaru@univ-amu.fr) MIO - Equipe EMBIO, Campus de Luminy Marseille

 

sujet 2013- 30.doc Interaction physique - biologie à micro-échelle : impact de la turbulence sur la croissance phytoplanctonique par une approche DEB

Encadrants : Jean-Christophe POGGIALE

(Bât. TPR1; 4ème étage; 04 91 82 91 19; jean-christophe. poggiale@univ-amu.fr ) ; Yvan LAGADEUC (Université de Rennes 1, UMR CNRS 6553 Ecobio et OSUR

 

sujet 2013- 31.docx stage en bio-stat sur effort de pêche : C’est dans les vieux pots qu’on fait les meilleures soupes … de thons

Encadrant : Nicolas Bez (IRD-Sète) , IRD – CRH – Sète, <nicolas.bez@ird.fr>

 

sujet 2013- 32.pdf Ecologie trophique de deux communautés intertidales à canopée d'algue brune : approche isotopique (δ13C vs δ15N) et fonctionnelle

Encadrants : Pascal Riera (MCF, riera@sb-roscoff.fr) et François Bordeyne (Doc , fbordeyne@sb-roscoff.fr ), Station Biologique de Roscoff (29)

 

sujet 2013- 33.pdf  Modélisation 0D des efflorescences d’Alexandrium en Penzé et en rade de Brets. Impact de la diversité du phytoplancton et des conditions environnementales

Encadrants : Martin Plus ( Martin.Plus@ifremer.fr ), Annie Chapelle   (Annie.Chapelle@ifremer.fr ), Marc Sourisseau, Ifremer Brest

 

sujet 2013- 34.pdf Caractérisation fonctionnelle des procaryotes associés au biofilm microphytobenthique des vasières intertidales des Pertuis Charentais

Encadrants : Hélène Agogué, UMR LIENSs, La Rochelle,  helene.agogue@univ-lr.fr , tel : 05 46 50 76 50 Anniet Laverman, UMR Sisyphe, Paris, Anniet.Laverman@upmc.fr , tel : 01 44 27 62 56

 

sujet 2013- 35.pdf  Osmodétection chez les téléostéens : approches cellulaires

Encadrants : Catherine Lorin-Nebel (responsable, catherine.lorin@univ-montp2.fr,) Emilie Farcy (co-responsable), UMR 5119, ECOSYM (Ecologie des Systèmes Marins Côtiers,  Université Montpellier ,

 

sujet 2013- 36.doc  phénologique des gorgones Paramuricea clavata et Eunicella cavolinii (Cnidaria, Octocorallia) : influence des changements environnementaux

Encadrants •     Alexander ERESKOVSKY - DR CNRS – UMR 7263 IMBE - 04 91 04 16 21

       alexander.ereskovsky@imbe.fr , Didier AURELLE – MC Aix-Marseille Université – UMR 7263 IMBE - 04 91 04 16 18   didier.aurelle@imbe.fr

 

sujet 2013- 37.pdf Variabilité de l’abondance en particules et des communautés zooplanctoniques en Méditerranée Nord-Occidentale”

Encadrants : L.Guidi, L.Coppola, F.Carlotti, M-P. Jouandet, X.Durrieu de Madron, L.Stemmann

Contact: lguidi@obs-vlfr.frcoppola@obs-vlfr.fr

 

sujet 2013- 38.doc Etude des interactions entre la micro-algue toxique Alexandrium catenella et Vibrio splendidus LGP32, l’un des pathogènes de l’huître creuse Crassostrea gigas.

Encadrant : Jean-Luc Rolland , UMR 5119, IFREMER, Place E. Bataillon, CC93, 34095 Montpellier cedex 5, France  jlrollan@ifremer.fr 04.67.14.47.09

 

 

 

Archives : Liste des sujets de stage de M2 proposés, année 2012-2013

 

sujet 2012- 01.doc Amplification de girus marin par la mise en culture d’échantillons environnementaux en présence d’Acanthamoeba

encadrants : Chantal Abergel, Information Génomique & Structurale UPR 2589-CNRS Aix-Marseille Université Parc Scientifique de Luminy

 

sujet 2012- 02.doc Etude de la répartition spatiale des foraminifères benthiques dans l’estuaire de la Loire : vers le développement d’un indice biotique

encadrants : Meryem MojtahidTél :   02 41 73 50 02 Fax :         02 41 73 53 52 Email :meryem.mojtahid@univ-angers.fr, UMR 6112 LPGN - BIAF

Laboratoire des Bio-Indicateurs Actuels et Fossiles, Université d’Angers

 

sujet 2012- 03.doc Etude de la réponse de la méiofaune benthique à l’anoxia : expérience en laboratoire

encadrants : Geslin Emmanuelle, C. Barras Tél :            02 41 73 54 07 Fax :         02 41 73 53 52 Email :               emmanuelle.geslin@univ-angers.fr, UMR 6112 LPGN – BIAF Laboratoire des Bio-Indicateurs Actuels et Fossiles, Université d’Angers

 

sujet 2012- 04.doc Variabilité interannuelle des flux de matières et de foraminifères planctoniques dans le Golfe de Gascogne

encadrants : Howa Hélène, Tél :           02 41 73 53 80 Fax :         02 41 73 53 52

Email :               helene.howa@univ-angers.fr, UMR 6112 LPGN – BIAF Laboratoire des Bio-Indicateurs Actuels et Fossiles, Université d’Angers

 

sujet 2012- 05.doc Etude de l’adaptation de Desulfovibrio piezophilus à la haute pression hydrostatique.

Encadrants Nathalie Pradel, nathalie.pradel@univ-amu.fr, Institut Mediterranéen d’Océanographie , Luminy, Marseille

 

sujet 2012- 06.doc Evolution et adaptation entre flux de gènes et sélection locale: analyse de la diversité génétique du transcriptome chez le corail rouge

Encadrants: D. Aurelle (MC AMU), Pierre Pontarotti (DR CNRS)

Contact didier.aurelle@univ-amu.fr, IMBE, Marseille

 

sujet 2012- 07.doc Diversité de réponse au stress thermique chez la gorgone E. cavolinii: étude de l'expression de gènes candidats

Encadrants: D. Aurelle (MC AMU), , Isabelle Pivotto (Doc IMBE)

Contact didier.aurelle@univ-amu.fr, IMBE, Marseille

 

sujet 2012- 08.doc Dynamique des bactéries à protéorhodopsine en milieu marin côtier

Encadrants: Christian JEANTHON (DR), Dominique BŒUF (Doc)

Nom et adresse du laboratoire d’accueil : Adaptation et Diversité dans le Milieu Marin (UMR 7144), Station Biologique, Roscoff. Téléphone : 02 98 29 23 79 ;             email :  jeanthon@sb-roscoff.fr

 

sujet 2012-9.doc Activité anti-adhésion de microalgues de l’Océan Indien. Développement d’un bio-essai in vitro plurispécifique

Encadrants: Jean-François Briand, Laboratoire MAPIEM -EA 4323- Biofouling & substances naturelles marines, Université du Sud Toulon-Var

Avenue George Pompidou, B.P. 56,  83162 La Valette-du-Var Cedex

Tél.: 04 94 14 67 60 (ou 23 76), E-mail : briand@univ-tln.fr

 

sujet 2012- 10.doc Développer et valider des indices de condition chez les poissons petits pélagiques du Golfe du Lion

Encadrants : Claire Saraux (IFREMER Sète), Jean-Hervé Bourdeix (IFREMER Sète) Ifremer station de Sète (UMR 212)  Unité: Ressources halieutiques

 

 

sujet 2012- 11.pdf Variabilités génotypiques, phénotypiques et expressionnelles chez l'huître perlière, Pinctada margaritifera.

Encadrants : Chin Long KY Carole BLAY & Julie FIEVET Laboratoire écosystème perlicole, Ifremer, Vairao, Tahiti, Polynésie française  chinky@ifremer.fr

 

sujet 2012- 12.doc Discrétisation de la mortalité par pêche globale par flottille et simulations de divers scénarios de gestion sur quelques espèces commerciales et leur écosystème

Encadrants : Morgane TRAVERS-TROLET, Paul MARCHAL, Youen VERMARD, IFREMER Manche-Mer du Nord, 150 quai Gambetta, BP 699, 62321 Boulogne-sur-Mer Cedex. Morgane.Travers@ifremer.fr,

 

sujet 2012- 13.doc Etude temporelle à haute fréquence des communautés zooplanctoniques en Mer du Nord : taxonomie et dynamique

Encadrants  Alice DELEGRANGE (Doctorante – 2ème Année) Dorothée VINCENT (MCF) LOG, UMR CNRS 8187, Maison de la Recherche en Environnement Naturel, 32 avenue FOCH, 62930 Wimereux.

alice.delegrange@univ-littoral.fr, dorothee.vincent@univ-littoral.fr

 

sujet 2012-14.docx Caractérisation des communautés procaryotiques  du cycle de l’azote associé aux herbiers

Encadrants : P Bonin, V Michotey, MOI-Campus Luminy Marseille

Patricia.bonin@univ-amu.fr

 

sujet 2012-15.doc Développement d’un modèle de biodisponibilité de l’uranium pour la daphnie (modèle BLM)

Encadrant : Laureline Février, IRSN/PRP-Env/SERIS/L2BT - bât 186Ce Cadarache 13 115 Saint Paul-lez-Durance Cedex

Tel : 04.42.19.95.17,laureline.fevreir@irsn.fr

 

sujet 2012- 16.pdf Evolution rapide des mécanismes de l’osmorégulation chez des populations du copépode Eurytemora affinis lors d’invasions en eau douce

Encadrant : Guy Charmantier, UMR 5119, Université Montpellier 2

guy.charmantier@univ-montp2.fr

 

sujet 2012-17.docx Comportement et effets biologiques de nanomatériaux dans des écosystèmes aquatiques

Encadrants : Melanie Auffan (CR-CNRS, 04 42 97 15 43, auffan@cerege.fr), Alain Thiery (PR AMU, alain.thiery@univ-provence.fr )

 

sujet 2012- 18.doc Liens entre cheminement de la matière organique et les taux de contaminations métallique et organique au sein des réseaux trophiques des écosystèmes coralliens

Encadrant : Yves Letourneur, Université de la Nouvelle-Calédonie, Laboratoire LIVE (yves.letourneur@univ-nc.nc ; Tél : +687 29 03 85)

 

sujet 2012- 19.docx Caractérisation des capacités d’autoépuration par les communautés procaryotiques d’un site hypersalin d’intérêt industriel suite à une contamination par des hydrocarbures pétroliers

Encadrants : Cécile Militon, Aix-Marseille Université, Institut Méditerranéen d’Océanologie (cecile.militon@univ-amu.fr; Tél.: 04.91.82.93.29) ; Philippe Cuny, Aix-Marseille Université, Institut Méditerranéen d’Océanologie (philippe.cuny@univ-amu.fr; Tél.: 04.91.82.91.47)

sujet 2012- 20.doc Dynamique des assemblages phytoplanctoniques de l’étang de Berre déterminée par une approche automatisée à l’échelle individuelle des cellules (par cytométrie en flux)

Encadrants : G Gregori ,  D Nérini Aix-Marseille Université, Institut Méditerranéen d’Océanographie _MIO, Marseille

Gerald.gregori@univ-amu.fr

 

 

sujet 2012- 21.docx Structure du réseau trophique de l’étang de Berre, impact des populations de gélatineux.

Encadrants : Brian Hunt et Delphine Thibault-Botha, Aix-Marseille Université , MIO, equipe EMBIO, Luminy

Delphine.botha@univ-amu.fr

 

sujet 2012- 22.pdf Etude comparative des capacités dispersives des larves planula d’espèces d’hydraires incubatrices et à méduses.

Encadrant : Chloé BOURMAUD chloe.bourmaud@univ-reunion.fr; Bautisse POSTAIRE ; ECOMAR, FST, Université de La Réunion. Les travaux auront lieu à l’ARDA au Port et/ou à l’aquarium de St Gilles

 

 

sujet 2012- 23.docx Etude de la connectivité de populations d’hydraires du sud-ouest de l’océan Indien

Encadrant : Aurelle Didier, didier.aurelle@univ-amu.fr, 04 91 04 16 18, Université Aix-Marseille UMR 7263 IMBE, Magalon Hélène, helene.magalon@univ-reunion.fr, 02 62 93 86 76, Laboratoire ECOMAR, Université de la Réunion

 

sujet 2012- 24.doc Effet de la fertilisation naturelle en fer sur l’activité et la diversité des populations microbiennes dans l’océan austral

Encadrant : Ingrid Obernosterer , Laboratoire d’Océanographie Microbienne (LOMIC), Obsérvatoire Océanologique de Banyuls, 66650 Banyuls-sur-mer. Ingrid Obernosterer : Ingrid.obernosterer@obs-banyuls.fr, tel : 0468887353

 

 

sujet 2012- 25.doc Détermination et quantification des PCB dans les œufs et le plasma de soles adultes au cours d'un cycle de reproduction .

Encadrant : Véronique LOIZEAU, chercheurs au LBCO, Ifremer Brest ; vloizeau@ifremer.fr, Centre Ifremer de Nantes ou Brest

 

sujet 2012- 26.docx Assessment of the microbial communities in a desalination system

Encadrants: Dr. Sophie Leterme, Email: sophie.leterme@flinders.edu.au Dr Sergio Balzano, Ph 8201 2215, Email: sergio.balzano@flinders.edu.au. Adelaide Australia.

 

sujet 2012- 27.docx  Biofouling potential of microbial communities in a desalination system

Encadrants: Dr. Sophie Leterme, Email: sophie.leterme@flinders.edu.au Dr Sergio Balzano, Ph 8201 2215, Email: sergio.balzano@flinders.edu.au. Adelaide Australia

 

sujet 2012- 28.docx  Impact of a natural salinity gradient on the genetic diversity of microbial eukaryotes

Encadrants: Dr. Sophie Leterme, Email: sophie.leterme@flinders.edu.au Dr Sergio Balzano, Ph 8201 2215, Email: sergio.balzano@flinders.edu.au. Adelaide Australia

 

sujet 2012- 29.docx  Seasonal changes in pico and nanoeukaryotes in the South Australian continental shelf

Encadrants: Dr. Sophie Leterme, Email: sophie.leterme@flinders.edu.au Dr Sergio Balzano, Ph 8201 2215, Email: sergio.balzano@flinders.edu.au. Adelaide Australia

 

sujet 2012- 30.doc Caractérisation de la fonction de gènes impliqués dans le contrôle du développement musculaire chez me poisson zèbre

Encadrants: Xavier Cousin : xcousin@ifremer.fr, Ifremer ,Place Gaby Coll 17137 L’Houmeau (près La Rochelle)

 

sujet 2012- 31.pdf Effets des macrophytes sur les processus benthiques des milieux lagunaires méditerranéens eutrophisés

Encadrants : Vincent Ouisse, Ifremer - Station de Sète B.P. 171 - Boulevard Jean Monnet, 34203 Sète Cedex, vincent.ouisse@ifremer.fr

 

sujet 2012- 32.doc Evolution du couplage autotrophe - hétérotrophe dans un milieu peu profond soumis à une eutrophisation

Encadrants : Hugues Lemonnier (IFREMER) avec co-encadrement Martine Rodier (IRD ; Station Aquacole de Saint-Vincent (Ifremer), Boulouparis, Nouvelle Calédonie. Hugues.Lemonnier@ifremer.fr

 

sujet 2012- 33.docx Réévaluation de  la préservation ‘supposée’ de la MO terrestre dans les océans

Encadrants : RONTANI Jean-François (DR2- CNRS), CHARRIERE Bruno (IR2-CNRS), Aix-Marseille Université, MIO, Luminy,

jean-francois.rontani@univ-amu.fr

 

sujet 2012- 34.pdf Identification et origines de certains composés saccharidiques dans la matière organique dissoute (MOD) en milieu océanique

Encadrants : C. Panagiotopoulos, R. Sempéré, Aix-Marseille Université, MIO, Luminy, christos.panagiotopoulos@univ-amu.fr

 

sujet 2012- 35.docx Etude de l’alimentation des téléostéens planctonophages  (sardine, anchois et sprat) dans le Golfe du Lion

Encadrants : Daniela Banaru (MIO) et Claire Saraux (Ifremer Sète), MIO Marseille, Campus de Luminy ; Daniela.Banaru@univ-amu.fr

 

 

sujet 2012- 36.doc Étude pilote des mécanismes de l'évolution convergente chez les oiseaux

Encadrants : Pierre Pontarotti : Évolution Biologique et Modélisation UMR 7353

 

sujet 2012- 37.pdf Modélisation des habitats pour des populations benthiques à l’échelle de la Manche et du Golfe de Gascogne: approche bioénergétique

Encadrant : C. Bacher , Centre Ifremer de Brest, département DYNECO (www.ifremer.fr/dyneco), (cedric.bacher@ifremer.fr).

 

 

sujet 2012- 38.pdf Mesure de la silice biogénique et de la matière organique dans les sédiments des lobes du Congo

Encadrants : Olivier RAGUENEAU, Directeur de Recherche, Rudolph CORVAISIER, Ingénieur d’Etudes, Université de Brest  Olivier.Ragueneau@univ-brest.fr IUEM Bureau A128 02 98 49 86 56

 

 

sujet 2012- 39.doc Amélioration des connaissances sur le captage naturel de l’huître creuse dans la lagune de Thau et optimisation de la gestion des collecteurs dans une optique de production de juvéniles

Encadrant : Franck Lagarde, , Ifremer Station de Sète Laboratoire Environnement Ressources du Languedoc Roussillon, dopler.lr@ifremer.fr

 

sujet 2012- 40.doc Etude de la diversité des procaryotes multicellulaires magnétotactiques

Encadrant : Nathalie Pradel, nathalie.pradel@univ-amu.fr, Institut Mediterranéen d’Océanographie , Luminy, Marseille

 

sujet 2012- 41.pdf Plasticité phénotypique et évolution de la résistance au stress thermique

Encadrants : M Gauduchon , JC Poggiale Institut Mediterranéen d’Océanographie , Luminy, Marseille. mathias.gauduchon@univamu.fr

 

sujet 2012- 42.docx Distribution spatiale des assemblages microbiens en Méditerranée Nord-Occidentale en condition hivernale – Campagne océanographique DeWEX

Encadrants : G Gregory, M THYSSEN, Institut Mediterranéen d’Océanographie , Luminy, Marseille.  gerald.gregori@univ-amu.fr

 

sujet 2012- 43.doc Développement d'un modèle de dynamique de population et d'évaluation de stock combinant les stocks sud et nord de merlu (Merluccius merluccius) de l’Atlantique nord-est.

Encadrants: Michel Bertignac, Laboratoire de Biologie Halieutique Ifremer Centre de Brest et Santiago Cervino, IEO, Vigo, Espagne, lieu du stage Ifremer Centre de Brest. michel.bertignac@ifremer.fr

 

sujet 2012- 44.doc Modélisation des interactions Phytoplancton – Zooplancton : effet des migrations nychtémérales

Encadrants: François CARLOTTI (DR CNRS) Jean-Christophe POGGIALE (PR): MIO  – Case 901 – Campus de Luminy – 13288 Marseille – tel/fax : 04 91 82 91 19 – email : francois.carlotti@univ-amu.fr jean-christophe.poggiale@univ-amu.fr

 

sujet 2012- 45.doc Modèles de réseaux trophiques en environnement variable

Encadrants: Jean-Christophe POGGIALE (PR), David Nerini (MC) : MIO  – Case 901 – Campus de Luminy – 13288 Marseille – tel/fax : 04 91 82 91 19 – email : jean-christophe.poggiale@univ-amu.fr, david.nerini@univ-amu.fr

 

sujet 2012- 46.docx Suivi de l’évolution des herbiers à Posidonia oceanica le long du littoral de la Corse.

Encadrant: Gérard Pergent, Université de Corse et littoral de la Corse ; Université de Corse – Equipe « Ecosystèmes Littoraux » et GIS Posidonie

 

sujet 2012- 47.docx Etude de l’influence des paramètres physico-chimiques du milieu (température, salinité, luminosité) sur la biologie, la croissance et la production de pinnatoxines du dinoflagellé toxique Vulcanodinium rugosum

Encadrants: Eric Abadie (cadre de recherché IFREMER), Mohamed Laabir (Maître de Conférence, Université Montpellier 2), ECOSYM, MONTPELLIER, <laabir@univ-montp2.fr>

 

sujet 2012- 48.pdf Généralité de la sélection habitat-dépendante sur des marqueurs génétiques associés à la prolactine et à l’hormone de croissance chez la daurade (Sparus aurata)

Encadrant: GUINAND Bruno (MCF) bruno.guinand@um2.fr, Institut des Sciences de l’Evolution de Montpellier (ISE-M) – UMR CNRS 5554

 

sujet 2012- 49.doc Variations saisonnières de la diversité des larves de bivalves par utilisation d’outils moléculaires (barcoding)

Encadrant: Thierry Comtet , UMR 7144, Equipe Diversité et Connectivité dans les Paysages Marins Côtiers, Station Biologique, 29680 Roscoff (comtet@sb-roscoff.fr)

 

sujet 2012- 50.docx Approche multi-spécifique de la diversité moléculaire d’invertébrés marins en Manche ouest : rôle relatif des traits d’histoire de vie et des affinités biogéographiques

Encadrants: Claire Daguin-Thiébaut & Frédérique Viard, Station Biologique de Roscoff – Lab. Adaptation & Diversité en Milieu Marin- Equipe Diversité & Connectivité dans les Paysages Marins Côtiers, daguin@sb-roscoff.fr, viard@sb-roscoff.fr

 

sujet 2012- 51.pdf Effet d'une exposition chronique à des PCB et des PBDE sur la physiologie, notamment la reproduction, du poisson-zèbre (Danio rerio)

Encadrante : Marie-Laure Bégout - mlbegout@ifremer.fr, Ifremer, Place Gaby Coll ,17137 L’Houmeau (près La Rochelle)

 

Evolution des microalgues toxiques et des communautés phytoplanctoniques totales au cours du siècle passé

Encadrant : R Siano, Laboratoire Dyneco/Pelagos IFREMER BP 70, raffaele.siano@ifremer.fr

 

 

Approche photobiologique de la récupération post-stress chez les scléractiniaires hermatypiques Seriatopora hystrix et Acropora muricata

Encadrant : P Grosjean, Université de Mons, Pentagone (3D08), 8 avenue du Champ de Mars, Philippe.Grosjean@umons.ac.be

 

 

Etude génétique des baleines à bosse de Madagascar

Encadrant : JL Jung, Laboratoire BioGeMME, Brest

jung.jeanluc@gmail.com

 

Detecting and tracing farmed salmon with stable isotope otolith ‘fingerprint’ tags: developing and validating vaccine-based and inter-generational tag delivery techniques

 

<josiane.gilbert@bouches-du-rhone.gouv.fr>

 

 

Liste des sujets de stage de M2 proposés, année 2011-2012

 

sujet 2011-1.doc  « Implications écologiques des signatures microchimiques au sein des otolithes des poissons Anguilliformes du lagon sud-ouest de la Nouvelle-calédonie »

Co-encadrants : Yves Letourneur, Université de la Nouvelle-Calédonie, Laboratoire LIVE (yves.letourneur@univ-nc.nc ; Tél : (+687) 29 03 86) & Laurent Vigliola, IRD, Centre de Nouméa (laurent.vigliola@ird.fr ; Tél : (+687) 26 07 91)

 

sujet 2011-2.doc  « Premiers stades de colonisation des coraux morts par la microflore perforante: variabilité temporelle de sa diversité et de son abondance, et conséquences sur son activité érosive ».

Encadrant Aline Tribollet, Chargée de Recherche à l’UMR IPSL-LOCEAN (UPMC/CNRS/IRD/MNHN)  Centre I.R.D. France Nord, 32 Av. Henry Varagnat, 93143  Bondy Cedex  aline.tribollet@ird.fr

 

sujet 2011-3.doc « Effets in situ du pH sur l'activité érosive de la microflore perforante colonisant des coraux morts »

Encadrant Aline Tribollet, Chargée de Recherche IRD à l’UMR IPSL-LOCEAN  UMR IPSL-LOCEAN (UPMC/CNRS/IRD/MNHN), Equipe Paléoproxus, 4 Place Jussieu, F-75252 PARIS Cedex 05. E-mail : aline.tribollet@ird.fr

 

sujet 2011-4.doc« Effet de l’irradiation gamma sur le budget énergétique et la dynamique de population de Daphnia magna »

Co-encadrants Frédéric ALONZO   Laboratoire de Modélisation EnvironnementaleInstitut de Radioprotection et Sûreté Nucléaire -DEI/SECRE13115 ST PAUL LEZ DURANCE CEDEX  Tél. : 04 42 19 95 79   frederic.alonzo@irsn.fr   Jean-Christophe POGGIALE    Laboratoire de Microbiologie, de Géochimie et d'Ecologie Marines (UMR CNRS 6117), 13288 MARSEILLE CEDEX 9 , Tél. : 04 91 82 91 19   jean-christophe.poggiale@univmed.fr

 

stage2011- 5.pdf « Microzooplankton ecology in coastal waters »

Encadrant Dr. Wuchang Zhang, Professor Key Laboratory of Marine Ecology and Environmental Sciences Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences 7 Nanhai Road,Qingdao 266071 People's Republic of China,

 

sujet 2011- 6.pdf « Evaluation de la maturité des spermatozoïdesde l’huître perlière Pinctada margaritifera »

Encadrant : Marguerite MÉLEC-GOURSAUD Responsable du Centre Information Documentation Orientation

Université de la Polynésie française, BP 6570 – FAA’A – 98702 –TAHITI

Polynésie française Tél : 00 (689) 803 954 Marguerite.melec@upf.pf

 

sujet 2011- 7.pdf « Impact de l’acidification des océans sur la diversité et le rôle fonctionnel des communautés de macroalgues et herbivores associés »

Encadrant : Laure Noël, Station Biologique de Roscoff (UMR 7144 « AD2M » ; resp. F. Lallier) Station Biologique Roscoff, Place Georges-Teissier, 29680 Roscoff Tel./fax 02 98 29 23 23/02 98 29 23 24 : noel@sb-roscoff.fr

 

sujet 2011- 8.pdf « Impact de l’acidification des océans sur l’espèce invasive Crepidula fornicata »

Co-Encadrant : - Fanny Noisette (doctorante) et Sophie Martin (chercheur CNRS), Station Biologique de Roscoff (UMR 7144 « AD2M » , équipe ReTroProd ; http://www.sb-roscoff.fr/retroprod.html , Station Biologique Roscoff, Place Georges-Teissier, 29682 Roscoff

Tel./fax F. Noisette : 02 98 29 23 33  fanny.noisette@sb-roscoff.fr

 

sujet 2011-9.doc « Diversité des communautés microbiennes de biofilms  colonisant des peintures antifouling en milieu marin »

Encadrant : Jean-François Briand  Laboratoire MAPIEM -EA 4323- Biofouling & substances naturelles marines, Université du Sud Toulon-Var  Avenue George Pompidou, B.P. 56,  83162 La Valette-du-Var Cedex http://mapiem.univ-tln.fr/

Tél.: 04 94 14 25 79 (ou 23 76), E-mail : briand@univ-tln.fr

 

sujet 2011- 10.pdf « Modélisation de la cartographie du changement de structure sédimentaire »

Co-Encadrant : Anne-Françoise Yao, Claude Manté   Laboratoire de Microbiologie, de Géochimie et d'Ecologie Marines (UMR CNRS 6117), 13288 MARSEILLE CEDEX 9 ,yao@univmed.fr ;  mante@univmed.fr

 

sujet 2011- 11.pdf « Modélisation du rôle trophique des Haploops dans les écosystèmes de Bretagne sud. Application à la baie de Vilaine ».

Co-Encadrant : Philippe CUGIER, Centre Ifremer de Bretagne, Laboratoire d’Ecologie Benthique, Technopole BrestIroise, BP70, 29280 Plouzané cedex Tél : 02.40.37.41.60 Courriel : Philippe.Cugier@ifremer.fr Stanislas DUBOIS, Chercheur en écologie et réseau trophique, Tél : 02.23.48.59.28, Fax : 02.23.48.55.35, Courriel : Stanislas.Dubois@ifremer.fr

 

sujet 2011- 12.doc « Etude de la répartition spatiale du zooplancton dans la zone économique de Nouvelle Calédonie »

Encadrant : Marc Pagano LOPB/MIO(Luminy) : 04 91 82 91 34,  marc.pagano@univmed.fr

 

sujet 2011- 13.pdf « Modélisation du stockage du carbone et de sa re-consommation chez les cyanobactéries diazotrophes »

Encadrant : Olivier Bernard, olivier.bernard@inria.fr tel. 04 92 38 77 85 , Sophie Rabouille, srabouille@obs-vlfr.fr tel. 04 93 76 38 32 ; Antoine Sciandra, sciandra@obs-vlfr.fr tel. 04 93 76 38 19. Laboratoire d'Océanographie de Villefranche, UMR 7093. CNRS & Université Paris VI - Station Zoologique-B.P. 28 F-06234 Villefranche-Sur-Mer. Un logement à la station est possible.

 

sujet 2011- 14.pdf « Etude expérimentale de la réponse adaptative du phytoplancton à des signaux lumineux haute fréquence ».

Encadrant : Olivier Bernard, olivier.bernard@inria.fr tel. 04 92 38 77 85 , Sophie Rabouille, srabouille@obs-vlfr.fr tel. 04 93 76 38 32 ; Antoine Sciandra, sciandra@obs-vlfr.fr tel. 04 93 76 38 19. Laboratoire d'Océanographie de Villefranche, UMR 7093. CNRS & Université Paris VI - Station Zoologique-B.P. 28 F-06234 Villefranche-Sur-Mer. Un logement à la station est possible

 

sujet 2011- 15.pdf « Méthode d’analyse de sensibilité de modèles 2 - D de quantification de la Bioturbation »

Encadrant : Anne-Françoise Yao  Laboratoire de Microbiologie, de Géochimie et d'Ecologie Marines (UMR CNRS 6117), 13288 MARSEILLE CEDEX 9 ,yao@univmed.fr ;

 

sujet 2011- 16.doc  « Dualité osmorégulation / nutrition et plasticité phénotypique du système digestif chez le loup d’élevage »

Encadrant : Viviane Boulo & Jehan-Hervé Lignot, Equipe AEO (Adaptation Ecophysiologique et Ontogenèse), UMR 5119, Université Montpellier II, 34095 Montpellier cedex 05. Jehan-Herve.Lignot@univ-montp2.fr

 

sujet 2011- 17.doc « Cartographie quantitative des nourriceries côtières et estuariennes de sole dans le golfe de Gascogne : identification des habitats essentiels, estimation d’abondance et analyse des fluctuations du recrutement »

Encadrant : Pr Olivier Le Pape, tel : 02 23 48 55 31, email : Olivier.Le.Pape@agrocampus-ouest.fr

Stage de master 2 recherche, qui se déroulera en temps partagé entre Agrocampus Ouest (Rennes) et IFREMER (Nantes)

 

sujet 2011- 18.doc « Le méthyl mercure modifie-t-il le fonctionnement de la voie Notch chez les éponges? »

Co-Encadrant : Emmanuelle Deniel/ Carole Borchiellini ,equipe  « diversité et évolution des plans d'organisation des métazoaires » de l’IMBE

Station marine Endoume, Marseille

 

sujet 2011- 19.doc « Effets de la variabilité environnementale, de la distribution et de l’abondance des proies et du régime d’exploitation de la pêcherie sur l’effort de fourragement des fous et des cormorans du Pérou »

Encadrant  Dr Sophie Bertrand UMR 212 ‘Ecosystèmes marins exploités’ Laboratoire Mixte International IRD/IMARPE ‘DISCOH’

Avenue Jean Monnet – 34203 Sète E-mail : Sophie.Bertrand@ird.fr

Etudiante présentie Giannina Passuni

 

sujet 2011- 20.doc « Ajustement d’un modèle de dérive de particules pour simuler la dispersion du plancton gélatineux en Manche-Mer du Nord »

Encadrant : Morgane Travers-Trolet, IFREMER (Morgane.Travers@ifremer.fr – Tel : 03-21-99-50-65) IFREMER Manche-Mer du Nord, 150 quai Gambetta, BP 699, 62321 Boulogne-sur-Mer Cedex.

 

sujet 2011- 21.doc « Etude phénologique d’éponge Haliclona fulva (Demospongiae, Haplosclerida) : relation avec le métabolisme secondaire, et influence des changements environnementaux »

Co-Encadrants  Alexander ERESKOVSKY - DR CNRS – UMR 6540 DIMAR / IMBE - 04 91 04 16 49 ; alexander.ereskovsky@univmed.fr, Thierry PEREZ – CR CNRS – UMR 6540 DIMAR / IMBE- 04 91 04 16 29 ; thierry.perez@univmed.fr

 

 

sujet 2011- 22.doc « Taxonomie intégrative des éponges Homoscleromorpha: approches cytologique, chimique et moléculaire »

Co-Encadrants : Thierry PEREZ – CR CNRS – UMR 6540 DIMAR / IMBE- 04 91 04 16 29 ; thierry.perez@univmed.fr,Alexander ERESKOVSKY - DR CNRS – UMR 6540 DIMAR / IMBE - 04 91 04 16 49 ; alexander.ereskovsky@univmed.fr, Julijana IVANISEVIC – ATER IMEP / IMBE ; julijana.ivanisevic@univmed.fr, Pierre CHEVALDONNE – DR CNRS – UMR 6540 DIMAR / IMBE - 04 91 04 16 59 ; pierre.chevaldonne@univmed.fr

Etudiant  présentie : ---- sujet en attente de confirmation de possibilité de financement

 

sujet 2011- 23.doc  « Salinité et toxicité des métaux chez l'embryon de médaka marin , Biogéochimie et cinétique de contamination »

Co-Encadrants :Paco Bustamante (paco.bustamante@univ-lr.fr) et Xavier Cousin (xcousin@ifremer.fr), Ifremer L'Houmeau et UMR LIENSs Université de La Rochelle.

 

sujet 2011- 24.doc « Salinité et toxicité des métaux chez l'embryon de médaka marin, Caractérisation des mécanismes moléculaires mis en jeu »

Co-Encadrants : Benoit Simon-Bouhet (benoit.simon-bouhet@univ-lr.fr) et Xavier Cousin (xcousin@ifremer.fr); : Ifremer L'Houmeau et UMR LIENSs Université de La Rochelle

 

sujet 2011- 25.doc « Diversité génétique au locus GLU-5 chez les moules Mytilus de Kerguelen : recherche de sélection environnementale ».

Co-Encadrants : Anne CHENUIL, Jean-Pierre FERAL , UMR 6540 DIMAR / IMBE; jean-pierre.feral@univmed.fr

 

sujet 2011- 26.pdf « Diversité et biogéographie des Radiolaires et de leurs algues symbiotiques »

Encadrant : Fabrice Not. UMR7144 - Groupe Plancton – CNRS/UPMC, Station Biologique de Roscoff, Place Georges Teissier, 29680 Roscoff. Tel : 02 98 29 25 37, e-mail : not@sb-roscoff.fr

 

sujet 2011- 27.doc «Modélisation des interactions Phytoplancton – Zooplancton : effet des migrations nychtémérales»

Co-encadrant : François CARLOTTI (DR CNRS) : LOPB -  – Case 901 – Campus de Luminy – 13288 Marseille – tel/fax : 04 91 82 91 19 – email : francois.carlotti@univmed.fr Jean-Christophe POGGIALE (PR) : LMGEM – Case 901 – Campus de Luminy – 13288 Marseille – tel/fax : 04 91 82 91 19 – email : jean-christophe.poggiale@univmed.fr

 

sujet 2011- 28.doc « Devenir des Polybromodiphényléthers (PBDE) et des Polychlorobiphényles (PCB) chez la sole commune (Solea solea) au cours du cycle de reproduction »

Encadrant : Catherine MUNSCHY / Véronique LOIZEAU, chercheurs au LBCO, Ifremer Nantes / Brest cmunschy@ifremer.fr ; vloizeau@ifremer.fr. Merci de bien vouloir contacter les deux encadrants simultanément.

 

sujet 2011- 29.pdf  Estimation de l’abondance de la mégafaune marine en Polynésie française

Encadrant : Sophie Laran : sophie.laran@univ-lr.fr. CRMM, 5 allées de l’Océan, La rochelle

 

sujet 2011- 30.pdf « Identification et histoire des masses d’eau de la Zone de Minimum d’Oxygène (OMZ) du Pérou à partir d’observations in situ et de modélisation ».

Encadrant : Aurélien PAULMIER (IRD, LEGOS)  05 61 33 28 62, Aurelien.paulmier@legos.obs-mip.fr.

 

sujet 2011- 31.pdf "Caractérisation des capacités d’autoépuration par les communautés procaryotiques d’un site hypersalin d’intérêt industriel suite à une contamination par des hydrocarbures pétroliers"

Encadrants : Cécile Militon, Université de la Méditerranée, Aix Marseille II, Laboratoire LMGEM (cecile.militon@univmed.fr; Tél.: 04.91.82.93.29) ; Philippe Cuny, Université de la Méditerranée, Aix Marseille II, Laboratoire LMGEM (philippe.cuny@univmed.fr; Tél.: 04.91.82.91.47)

 

sujet 2011- 32.pdf " Caractériser la dynamique spatio-temporelle des dispositifs de concentration de poissons (DCP) artificiels utilisés par la pêcherie de senneurs français dans les océans Indien et Atlantique"

Encadarnts: E Chassot (e mmanuel . c hassot@ird.fr ; Tél. 04-99-57-32-24) – DM Kaplan (david.kaplan@ird.fr ; Tél. 04-99-57-32-27)  Avenue Jean Monnet, BP 171, 34203 Sète cedex. Collaborations : Rocio Joo (IRD-IMARPE), Armateurs de pêche tropicale française via l'association ORTHONGEL

 

sujet 2011- 33.doc Composition et abondance du protozooplancton de l’Etang de Berre. Relation avec le zooplancton gélatineux

Encadrant: Jean Blanchot et Dephine Botha  Université de la Méditerranée, Aix Marseille II  LOPB/’MIO  LUMINY

 

sujet 2011- 34.pdf Utilisation des images satellitales pour simuler la sensibilité des populations benthiques aux changements environnementaux à l’échelle de la Manche et de la mer du Nord

Encadrant: C. Bacher (cedric.bacher@ifremer.fr)Le stage se déroulera au Centre Ifremer de Brest, département DYNECO (www.ifremer.fr/dyneco)

 

sujet 2011- 35.doc Stockage du carbone organique dans les mangroves (biomasse et substrat)

Co-Encadrants:  Michel Allenbach (MdCF, UNC)Université de la Nouvelle-Calédonie. allenbach@univ-nc.nc Cyril Marchand (CR, IRD)  Centre IRD de Nouméa Tel.: +687 26 07 66 Fax: +687 26 43 26 cyril.marchand@ird.fr

 

sujet 2011- 36.pdf Ecologie du mérou géant en Guyane Française

Encadrant: Céline ATERO ONCFS C°/ IFREMER? Domaine de Suzini - BP477 - 97331 Cayennne Standard : + 594 (0)5 94 30 22 00? Tel : + 594 (0)6 94 45 81 17; celine.artero.merou@gmail.com; bonnes capacités en statistiques demandées

 

sujet 2011- 37.doc Ecologie moléculaire de l’artémie invasive Artemia franciscana au Canada

Encadrant: Andy J. Green & Christophe Lejeusne.  Estación Biologica de Doñana-CSIC. Espagne. Tél : (+34) 954 232 340, Fax : (+34) 954 621 125, Email :             ajgreen@ebd.csic.es ou lejeusne@ebd.csic.es

 

sujet 2011- 38.pdf  Etude de la dynamique bactérienne soumise à un forçage de température

Encadrant: France Van Wambeke   france.van-wambeke@univmed.fr 04 91 82 90 49 Lieu du stage : Laboratoire de Microbiologie, Géochimie et Ecologies Marines

(LMGEM), campus de Luminy

 

sujet 2011- 39.doc "Mise en place de différents tests standardisés liés à la directive européenne REACH" Encadrants: Stéphane Le Floch, Stephane.Le.Floch@cedre.fr, Matthieu DussauzeMatthieu.Dussauze@cedre.fr.  Centre de Documentation, de recherche et d’Expérimentation sur les pollutions accidentelles des eaux

715 rue Alain Colas, CS 41836, 29218 Brest CEDEX 2, France –http://www.cedre.fr

 

sujet 2011- 40.doc Influence du nombre de copies de gènes sur le polymorphisme d'expression chez des loups de mer (Dicentrarchus labrax) présentant des phénotypes distincts de de tolérance au jeûne

Encadrant: Jean-Christophe Avarre et Bruno Guinand Institut des Sciences de l’Evolution de Montpellier (UMR CNRS 5554 ; http//www.isem.cnrs.fr/)

Conservation and Domestication Department

Université Montpelier II - France

 

Sujet 2011-41.pdf  Contribution à la méthodologie d’évaluation de l’état de conservation de l’habitat d’intérêt communautaire prioritaire 1150  Lagunes côtières à l’échelle du site Natura 2000.

Encadrant : Sonia Bertrand,chargée de projets Languedoc-Roussillon Programme Pôle-relais lagunes méditerranéenne           pole.lagunes.lr@cenlr.org

 

sujet 2011- 42.pdf Etude du rôle ancestral de la molécule immune C3 dans les mécanismes cellulaireset moléculaires de la réparation tissulaire chez le corail Acropora muricata

Encadrant: Pr Gasque Philippe, Groupe de recherche en immunopathologies et maladies infectieuses(GRI-EA4517), Université de la Réunion gasquep@hotmail.com, tél : 0262904306

Pr Bruggemann Henrich, Laboratoire d’Ecologie marine (ECOMAR-EA8),

henrich.bruggemann@univ-reunion.fr, tél: 0262938178

Dr Guillaume Mireille, MNHN-UMR BOREA/ECOMAR, guillaum@mnhn.fr,

tel: 02 62 93 87 29

GRI (Groupe de recherche en immunopathologies et maladies infectieuses, EA4517), ECOMAR (Laboratoire d’Ecologie Marine, EA8)

 

Diversité microbienne sédimentaire soumise à des fluctuations de salinité

Encadrant : Patricia Bonin (patricia.Bonin@univmed.fr) et valérie Michotey (valerie.michotey@univmed.fr) LMGEM, Campus de Luminy, Marseille